RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 SERPINA1P01009 418 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ABHD2P08910 425 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ANXA3P12429 323 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A1P30531 599 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CSF2RBP32927 897 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL3P36405 182 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CDH11P55287 796 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4D1Q15615 310 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF404Q494X3 552 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35F4A4IF30 521 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DKK1O94907 266 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 VAPBO95292 243 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DDAH2O95865 285 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HLA-EP13747 358 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FOLR2P14207 255 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TBPP20226 339 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR2DL3P43628 341 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CEACAM7Q14002 265 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PYCR3Q53H96 274 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LILRA6Q6PI73 481 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MITD1Q8WV92 249 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SUSD3Q96L08 255 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 D6RAR5 112 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIAL4DF5H284 164 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SCELO95171 688 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM253P0C7T8 217 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FSHRP23945 695 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ELK3P41970 407 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NPBWR1P48145 328 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PDLIM4P50479 330 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R39P59534 338 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZP4Q12836 540 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC10A1Q14973 349 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 IER5Q5VY09 327 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ASB11Q8WXH4 323 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MYLIPQ8WY64 445 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF122Q9H9V4 155 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf109Q9NX04 203 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 WNT9AO14904 365 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FFAR2O15552 330 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ST8SIA3O43173 380 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ALPIP09923 528 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB31Q13636 194 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TAZQ16635 292 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIQKQ629K1 86 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PQLC3Q8N755 202 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1S1Q8NH92 325 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLCO2A1Q92959 643 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CMKLR1Q99788 373 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SYT11Q9BT88 431 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.31□□□□□ -1.4
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