RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 OR2W5A6NFC9 320 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 RFPL4AA6NLU0 287 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 ARL6IP5O75915 188 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 S100A6P06703 90 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 UCHL1P09936 223 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 ACADLP28330 430 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 ZNF85Q03923 595 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 AVPI1Q5T686 147 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 NR4A3Q92570 626 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 DYRK1BQ9Y463 629 aa20.15■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 RAB19A4D1S5 217 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 CDHR4A6H8M9 788 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 CDC42EP2O14613 210 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 PYCR1P32322 319 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 DECR1Q16698 335 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 TSSK4Q6SA08 328 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 SPAG16Q8N0X2 631 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 GJD3Q8N144 294 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 CRB3Q9BUF7 120 aa20.14■□□□□ 0.82
OPN3-201ENST00000366554 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PLPP1O14494 284 aa20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 P2RX1P51575 399 aa20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 GPR143P51810 404 aa20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 C5orf46Q6UWT4 87 aa20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 TCEAL3Q969E4 200 aa20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 VWA8A3KMH1 1905 aa20.14■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 TSPAN6O43657 245 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PRR5P85299 388 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 SZRD1Q7Z422 152 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 ZFP82Q8N141 532 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 SGPP1Q9BX95 441 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 TMEM82A0PJX8 343 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PIP5K1CO60331 668 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PTHLHP12272 177 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 GJA5P36382 358 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PTGFRP43088 359 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 C10orf91Q5T1B1 145 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 STK35Q8TDR2 534 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 ELP5Q8TE02 316 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 ARHGDIGQ99819 225 aa20.13■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 A0A1B0GTQ1 180 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 GATCO43716 136 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 RAD1O60671 282 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 AKR7A3O95154 331 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 IGSF6O95976 241 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 S100A8P05109 93 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 DPP4P27487 766 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PPIAP62937 165 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 LILRB2Q8N423 598 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 THAP6Q8TBB0 222 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 TEAD3Q99594 435 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 ZFP57Q9NU63 452 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PCDHB10Q9UN67 800 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 MYO10Q9HD67 2058 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 SYT5O00445 386 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 THY1P04216 161 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 ZNF806P0C7X5 589 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 CBFBQ13951 182 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 RXFP4Q8TDU9 374 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 SCAMP4Q969E2 229 aa20.12■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 A0A0D9SG52 128 aa20.11■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 SBK2P0C263 348 aa20.11■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 PDHA2P29803 388 aa20.11■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 RPE65Q16518 533 aa20.11■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 CORO6Q6QEF8 472 aa20.11■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.11■□□□□ 0.81
OPN3-201ENST00000366554 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms