RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PRPS1P60891 318 aa9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BAXQ07812 192 aa9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MMP21Q8N119 569 aa9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SCML4Q8N228 414 aa9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.9□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 HRH2P25021 359 aa9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 HTR6P50406 440 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF45Q02386 682 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 OR10J4P0C629 311 aa9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CNIH2Q6PI25 160 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC6A18Q96N87 628 aa9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 EMC3Q9P0I2 261 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FAM166BA8MTA8 275 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NDUFB7P17568 137 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GM2AP17900 193 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SSTR2P30874 369 aa9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 RGNQ15493 299 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BTBD2Q9BX70 525 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SGPP1Q9BX95 441 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TTLL8A6PVC2 850 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZFAND5O76080 213 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 M6PRP20645 277 aa9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 TESK1Q15569 626 aa9.89□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MKXQ8IYA7 352 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SPARTQ8N0X7 666 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR4A16Q8NH70 328 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NT5C3BQ969T7 300 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BMFQ96LC9 184 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FAM173AQ9BQD7 235 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HES7Q9BYE0 225 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GNG12Q9UBI6 72 aa9.89□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SNED1Q8TER0 1413 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NDUFB2O95178 105 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SCGB1D1O95968 90 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 EGFP01133 1207 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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