RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 GXYLT1Q4G148 440 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 XKR6Q5GH73 641 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 LINGO4Q6UY18 593 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 GID4Q8IVV7 300 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ARL11Q969Q4 196 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ACER3Q9NUN7 267 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 KCND3Q9UK17 655 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRN3E7EW58 273 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 EREGO14944 169 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 OR10H2O60403 315 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CD3GP09693 182 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 DRD5P21918 477 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ACHEP22303 614 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 S100A2P29034 98 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 AGTR1P30556 359 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 EFNA5P52803 228 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 F2RL1P55085 397 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SELENOWP63302 87 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ACVR1Q04771 509 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SCAPQ12770 1279 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 RAB40BQ12829 278 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CNTN1Q12860 1018 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 PIGXQ8TBF5 258 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TGM7Q96PF1 710 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 JAM3Q9BX67 310 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 UBQLN3Q9H347 655 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF69Q9UC07 566 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 F5H5P2 479 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TNFRSF10BO14763 440 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 MOSPD3O75425 235 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 F10P00742 488 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ADAP00813 363 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SERPIND1P05546 499 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CD5P06127 495 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 GUSBP08236 651 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 LIMS3P0CW19 117 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 LIMS4P0CW20 117 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC25A4P12235 298 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 BCKDHAP12694 445 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 OSMP13725 252 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 MPIP34949 423 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 PPM1AP35813 382 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 XCR1P46094 333 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 BDH1Q02338 343 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 TCTN1Q2MV58 587 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 MESTQ5EB52 335 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 DOK6Q6PKX4 331 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 DRAM2Q6UX65 266 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 DPPA4Q7L190 304 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 SPRED2Q7Z698 418 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CDK20Q8IZL9 346 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 NPWQ8N729 165 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF2E1-201ENST00000283875 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms