RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 AK1P00568 194 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ACP2P11117 423 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 DAPP51397 102 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 GPR50Q13585 617 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SLC14A2Q15849 920 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CPZQ66K79 652 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SERPINA11Q86U17 422 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 INPP5KQ9BT40 448 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 V9GY05 133 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 MEGF11A6BM72 1044 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 MAN2B1O00754 1011 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 KLK1P06870 262 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ACP5P13686 325 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF250P15622 560 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 HSD11B1P28845 292 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RPS25P62851 125 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 DECR1Q16698 335 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 BTLAQ7Z6A9 289 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR5M3Q8NGP4 307 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LINC00052Q96N35 136 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 C20orf27Q9GZN8 174 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LDAHQ9H6V9 325 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PDYNP01213 254 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR13C7P0DN81 318 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ARAFP10398 606 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LAP3P28838 519 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CLDN10P78369 228 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SCGB2A2Q13296 93 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OLIG2Q13516 323 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PET117Q6UWS5 81 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RDH10Q8IZV5 341 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LILRB2Q8N423 598 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR4K17Q8NGC6 315 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LMO3Q8TAP4 145 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SEC22AQ96IW7 307 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PRODH2Q9UF12 536 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SCML1Q9UN30 329 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CXCR1P25024 350 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SDHAP31040 664 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SEC13P55735 322 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ACY1Q03154 408 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 DSC1Q08554 894 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR4M1Q8NGD0 313 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR6N2Q8NGY6 317 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF417Q8TAU3 575 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 EXTL1Q92935 676 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RELTQ969Z4 430 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 BABAM2Q9NXR7 383 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CDHR4A6H8M9 788 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RFC3P40938 356 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 GDF5P43026 501 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 C3orf38Q5JPI3 329 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR2G2Q8NGZ5 317 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PTP4A1Q93096 173 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR5M11Q96RB7 305 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PDE7BQ9NP56 450 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 INPP5EQ9NRR6 644 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ACVRL1P37023 503 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ARL6IP1Q15041 203 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TXNDC8Q6A555 127 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LCN10Q6JVE6 187 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A15Q8IZD6 547 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ASB13Q8WXK3 278 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 NTMT1Q9BV86 223 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TUBB1Q9H4B7 451 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF385DQ9H6B1 395 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SLC2A9Q9NRM0 540 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 GKN1Q9NS71 199 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 FBXL12Q9NXK8 326 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A14Q9Y267 594 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TERTO14746 1132 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 BRINP1O60477 761 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 IFNGR1P15260 489 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 FPR3P25089 353 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RPS21P63220 83 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms