RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253122.9

SLC6A8-201, Transcript of solute carrier family 6 member 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A8, Length 3,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8-201ENST00000253122 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 KIAA0355O15063 1070 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MPC2O95563 127 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CTRB1P17538 263 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 VAMP1P23763 118 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CCR9P51686 369 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SKP1P63208 163 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ACTC1P68032 377 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ACTA1P68133 377 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 WBP1LQ9NX94 342 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 OR6A2O95222 327 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ATP1B1P05026 303 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 FPR3P25089 353 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC6A6P31641 620 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 OR6V1Q8N148 313 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 TEAD3Q99594 435 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 C21orf58P58505 322 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 GRM7Q14831 915 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 YIPF5Q969M3 257 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 LRRC46Q96FV0 321 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 C5orf51A6NDU8 294 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SIGLEC5O15389 551 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SGCGQ13326 291 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 LCTLQ6UWM7 567 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 C6P13671 934 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 PPP3CBP16298 524 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 GPNMBQ14956 572 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CHST4Q8NCG5 386 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SERTM1A2A2V5 107 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TPPPO94811 219 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 RLN2P04090 185 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ACRP10323 421 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CSF2RAP15509 400 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 PDX1P52945 283 aa14.75□□□□□ -0.05
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SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 KCTD9Q7L273 389 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 PFN4Q8NHR9 129 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MED17Q9NVC6 651 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TBX21Q9UL17 535 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CARNS1A5YM72 827 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SOD2P04179 222 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 FOXK2Q01167 660 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MAPK14Q16539 360 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF546Q86UE3 836 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TTLQ8NG68 377 aa14.75□□□□□ -0.05
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