RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 EDAQ92838 391 aa21■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 C3orf49Q96BT1 292 aa21■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 MCCC2Q9HCC0 563 aa21■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 GALNT8Q9NY28 637 aa21■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 HAO2Q9NYQ3 351 aa21■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 PILRBQ9UKJ0 227 aa21■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 NDUFB2O95178 105 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 APOL3O95236 402 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 UTS2O95399 124 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 IL1AP01583 271 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SKP2Q13309 424 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 NSDHLQ15738 373 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 BTLAQ7Z6A9 289 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ACBD7Q8N6N7 88 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF321PQ8N8H1 164 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 C17orf47Q8NEP4 570 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 OR51A7Q8NH64 312 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 MROQ9BYG7 248 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 NUAK2Q9H093 628 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 C12orf10Q9HB07 376 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SPTBP11277 2137 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 CAPZA2P47755 286 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 RORCP51449 518 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 GPR50Q13585 617 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 EBPQ15125 230 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ISXQ2M1V0 245 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SAP25Q8TEE9 199 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 MED18Q9BUE0 208 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ADAMTS20P59510 1910 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 FAM183AA6NL82 134 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 A8MUA0 341 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TDGF1P13385 188 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TSSK4Q6SA08 328 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SHFQ7M4L6 423 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 OR1N1Q8NGS0 311 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 PTP4A1Q93096 173 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 NUDT9Q9BW91 350 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 VN1R1Q9GZP7 353 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 KLHL21Q9UJP4 597 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 WWP2O00308 870 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF264O43296 627 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 MYF5P13349 255 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 GALP22466 123 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A8P48029 635 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 POU4F2Q12837 409 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 VWA2Q5GFL6 755 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SIRT6Q8N6T7 355 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 LIPHQ8WWY8 451 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 LMF1Q96S06 567 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PQD3 144 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ISPDA4D126 451 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 PPP1R3DO95685 299 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 OCM2P0CE71 109 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 SLC2A5P22732 501 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 ARSGQ96EG1 525 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 KCTD7Q96MP8 289 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 TEAD3Q99594 435 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 LAT2Q9GZY6 243 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD9-201ENST00000249499 CHRNA9Q9UGM1 479 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms