RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 REEP3Q6NUK4 255 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 LILRA2Q8N149 483 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 HIPK4Q8NE63 616 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 OR10D3Q8NH80 312 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 WNT2BQ93097 391 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 RCN3Q96D15 328 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 UCN2Q96RP3 112 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SH3GL1Q99961 368 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 CHST11Q9NPF2 352 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ACER3Q9NUN7 267 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 GID8Q9NWU2 228 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 IFT52Q9Y366 437 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ZNF175Q9Y473 711 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 CACNA1CQ13936 2221 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ADAM11O75078 769 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SYNGR4O95473 234 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 NPPAP01160 153 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 OPN1LWP04000 364 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SHC1P29353 583 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PRKAR1BP31321 381 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PCGF2P35227 344 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ZNF136P52737 540 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 RBBP4Q09028 425 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 RABL3Q5HYI8 236 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 HBMQ6B0K9 141 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 OR2A2Q6IF42 318 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ZNF550Q7Z398 422 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 GRINAQ7Z429 371 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SERPINA11Q86U17 422 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PTOV1Q86YD1 416 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 FIG4Q92562 907 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 LRRC58Q96CX6 371 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ADGRG7Q96K78 797 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ZNF607Q96SK3 696 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 UCK2Q9BZX2 261 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 RLIMQ9NVW2 624 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 DOCK7Q96N67 2140 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PRORSD1PA6NEY8 169 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 FAAHO00519 579 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 AIM2O14862 343 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 ADAMDEC1O15204 470 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 CXCL13O43927 109 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 SERPINB7O75635 380 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 RCBTB2O95199 551 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 TGM6O95932 706 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 GKN3PP0CG01 181 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 TFPIP10646 304 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-214ENST00000625905 COX4I1P13073 169 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms