RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614837.1

ATP5D-209, Transcript of ATP synthase subunit delta, mitochondrial, human

TSL 2

Gene ATP5D, Length 343 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP5D-209	ENST00000614837	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ABCA4	P78363	2273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	AP3D1	O14617	1153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CRH	P06850	196 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	NID1	P14543	1247 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ARFIP2	P53365	341 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	RETREG3	Q86VR2	466 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CMIP	Q8IY22	773 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PMM1	Q92871	262 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	STARD4	Q96DR4	205 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PIGM	Q9H3S5	423 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837		A0A1W2PNR3	127 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	SYNGR4	O95473	234 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	FCGR2A	P12318	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	SSTR2	P30874	369 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CARD18	P57730	90 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	TLE4	Q04727	773 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	MERTK	Q12866	999 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	GMEB1	Q9Y692	573 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837		A0A0G2JPF8	293 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	GJE1	A6NN92	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837		A8MXE2	369 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ANGPT2	O15123	496 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	GKN3P	P0CG01	181 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ARAF	P10398	606 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	GPX2	P18283	190 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CPA2	P48052	419 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	KRTAP10-9	P60411	292 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	MYBPH	Q13203	477 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	GNA13	Q14344	377 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	DPP10	Q8N608	796 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	GALNT8	Q9NY28	637 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP5D-209	ENST00000614837	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP5D-209	ENST00000614837	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP5D-209	ENST00000614837	MSTN	O14793	375 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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