RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 OCM2P0CE71 109 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ETV6P41212 452 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 COPZ1P61923 177 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGADQ13349 1161 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 POGLUT1Q8NBL1 392 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52I1Q8NGK6 324 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 HHATLQ9HCP6 504 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAP2Q9NPF8 381 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFB11Q9NX14 153 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 HSMCR30P0CW71 290 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 GRK5P34947 590 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SSX1Q16384 188 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF620Q6ZNG0 422 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF595Q8IYB9 648 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCF1Q8N6M8 205 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 OIT3Q8WWZ8 545 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 JAM3Q9BX67 310 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 EPHA6Q9UF33 1036 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CDHR4A6H8M9 788 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJB6O75190 326 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 DLGAP3O95886 979 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ADRA2AP08913 450 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM87AP0C7U9 286 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 MYL12AP19105 171 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH3P22223 829 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPZBP47756 277 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 GAS1P54826 345 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM53BQ14153 422 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 OXA1LQ15070 435 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF613Q6PF04 617 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 HS6ST2Q96MM7 605 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 TGM7Q96PF1 710 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CDADC1Q9BWV3 514 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB33BQ9H082 229 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 STARD5Q9NSY2 213 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 STUB1Q9UNE7 303 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF860A6NHJ4 632 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 J3QKU1 62 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 DSCR3O14972 297 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 STK17BO94768 372 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ST6GAL1P15907 406 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 S100A5P33763 92 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNSP34059 522 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM52Q8NDY8 209 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 C7orf57Q8NEG2 295 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8D4Q8NGM9 314 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF559Q9BR84 538 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL25Q9H0H3 589 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FN3KQ9H479 309 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ENAMQ9NRM1 1142 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FRS3O43559 492 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 LDB3O75112 727 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PGGHGQ32M88 737 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS41Q7RTY9 318 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS42Q7Z5A4 293 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF554Q86TJ5 538 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 NKAIN4Q8IVV8 208 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 VWA5B2Q8N398 1253 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKK1Q8NFD2 765 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPOQ9BU64 300 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 EGLN3Q9H6Z9 239 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R16Q9NYV7 291 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA5BQ9P283 1151 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CHST10O43529 356 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CTNSO60931 367 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 THY1P04216 161 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CPEP16870 476 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 MTNR1AP48039 350 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR68Q15743 365 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF181Q2M3W8 571 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMC4Q5T2S8 1044 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 AADACL4Q5VUY2 407 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGN2P46Q86SG4 172 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB46Q86UZ6 589 aa23.41■■□□□ 1.34
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