RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587061.1

RPS6KB1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, human

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KB1-209	ENST00000587061	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-209	ENST00000587061	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-209	ENST00000587061	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-209	ENST00000587061	PCM1	Q15154	2024 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-209	ENST00000587061	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	OVOL3	O00110	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TOX	O94900	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ADCY5	O95622	1261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	JCHAIN	P01591	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	RAF1	P04049	648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	UGT1A4	P22310	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SLC6A12	P48065	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SEC16A	O15027	2179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CYR61	O00622	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SCRG1	O75711	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	PKLR	P30613	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	OTX2	P32243	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ASMT	P46597	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CAPZB	P47756	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TRPC1	P48995	793 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CLDN17	P56750	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TUBA1B	P68363	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ENPEP	Q07075	957 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SNTA1	Q13424	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	HCFC1	P51610	2035 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061		A0A1W2PPI3	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061		F8WDY8	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	SCO2	O43819	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	KIF5C	O60282	957 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-209	ENST00000587061	ATP1B1	P05026	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms