RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 RSC1A1Q92681 617 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SAMD8Q96LT4 415 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF681Q96N22 645 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2A7Q96R45 310 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SERINC2Q96SA4 455 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ABHD1Q96SE0 405 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MENTQ9BUN1 341 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX101Q9BY14 249 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCG4Q9H172 646 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNK12Q9HB15 430 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LYRM4Q9HD34 91 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL1Q9NR64 748 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR70Q9NW82 654 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RDH8Q9NYR8 311 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MOKQ9UQ07 419 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CKAP5Q14008 2032 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PR48 441 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT19A8MXV4 375 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IMPA2O14732 288 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ARPC3O15145 178 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFB6O95139 128 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TFP02787 698 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MELTFP08582 738 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CISD3P0C7P0 127 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IFI30P13284 250 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CSF2RAP15509 400 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC2A5P22732 501 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SHC1P29353 583 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GDNFP39905 211 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR4P46093 362 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR143P51810 404 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 BLVRAP53004 296 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CAV3P56539 151 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SKP1P63208 163 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SIRPAP78324 504 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CDK3Q00526 305 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NOGQ13253 232 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OPCMLQ14982 345 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PON3Q15166 354 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF626Q68DY1 528 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LIN54Q6MZP7 749 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LYPD8Q6UX82 237 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT77Q7Z794 578 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 STPG2Q8N412 459 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FTMTQ8N4E7 242 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CAMKVQ8NCB2 501 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 THAP4Q8WY91 577 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SMPDL3BQ92485 455 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CDS1Q92903 461 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ORAI1Q96D31 301 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C4orf36Q96KX1 117 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LDAHQ9H6V9 325 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FBRSQ9HAH7 460 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms