RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585299.1

NFE2L1-223, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 4

Gene NFE2L1, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-223	ENST00000585299	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		15.05	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	GLRX2	Q9NS18	164 aa		15.05	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ACER3	Q9NUN7	267 aa		15.05	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		15.05	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		15.05	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		15.05	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299		A0A096LPI6	279 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CLDN24	A6NM45	220 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299		A6NNC1	897 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ENO4	A6NNW6	628 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	NID1	P14543	1247 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	DSTN	P60981	165 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PLAUR	Q03405	335 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SPDL1	Q96EA4	605 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CALML5	Q9NZT1	146 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PROCR	Q9UNN8	238 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		15.04	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CLIC1	O00299	241 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	NR5A2	O00482	541 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	TFPT	P0C1Z6	253 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	IL7R	P16871	459 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	RYK	P34925	604 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CPOX	P36551	454 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CD79B	P40259	229 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CTBP2	P56545	445 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	FAM27E3	Q08E93	113 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	MERTK	Q12866	999 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	GNA13	Q14344	377 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SQLE	Q14534	574 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	AGK	Q53H12	422 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF563	Q8TA94	476 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	DACH2	Q96NX9	599 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	RASSF1	Q9NS23	344 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		15.03	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	ADAM11	O75078	769 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLC7A1	P30825	629 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CRISP3	P54108	245 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	RAC3	P60763	192 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	RGN	Q15493	299 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CDH24	Q86UP0	819 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	RNF128	Q8TEB7	428 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	NPHS2	Q9NP85	383 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		15.02	■□□□□ -0
NFE2L1-223	ENST00000585299	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299		A0A1W2PNR3	127 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	SH3D21	A4FU49	640 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	TMEM247	A6NEH6	219 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	BCHE	P06276	602 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	BMP2	P12643	396 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	POU2F1	P14859	743 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	FADD	Q13158	208 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
NFE2L1-223	ENST00000585299	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		15.01	□□□□□ -0.01

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