RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 A0A1W2PPB8 328 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 A0A1W2PRS3 328 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM166BA8MTA8 275 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TAF4O00268 1085 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAAHO00519 579 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 CLOCKO15516 846 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 CHP2O43745 196 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TPST2O60704 377 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 CBR3O75828 277 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRAPPC6AO75865 159 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 DIRAS1O95057 198 aa5.99□□□□□ -1.45
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CTDNEP1-204ENST00000570484 CAPNS1P04632 268 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM87AP0C7U9 286 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 THRBP10828 461 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 PNMTP11086 282 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRG2P13727 222 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF23P17027 643 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 HK1P19367 917 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 CXCR1P25024 350 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 DPP4P27487 766 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 IFNGR2P38484 337 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 EIF1P41567 113 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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CTDNEP1-204ENST00000570484 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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CTDNEP1-204ENST00000570484 MERTKQ12866 999 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 FOXF1Q12946 379 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 GK3PQ14409 553 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 QPRTQ15274 297 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR1Q1Q15612 314 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRIP10Q15642 601 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 NPTX1Q15818 432 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ATP6AP1Q15904 470 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 COLEC12Q5KU26 742 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 C3orf33Q6P1S2 294 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF613Q6PF04 617 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ULK3Q6PHR2 472 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 CBLN3Q6UW01 205 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.99□□□□□ -1.45
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CTDNEP1-204ENST00000570484 APOOLQ6UXV4 268 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 RRM2BQ7LG56 351 aa5.99□□□□□ -1.45
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CTDNEP1-204ENST00000570484 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR2M3Q8NG83 312 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 RNF138Q8WVD3 245 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ST8SIA1Q92185 356 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC38A4Q969I6 547 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 SCMH1Q96GD3 660 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC41A3Q96GZ6 507 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 MPP4Q96JB8 637 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 HES7Q9BYE0 225 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 VCX3BQ9H321 246 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 DSN1Q9H410 356 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANKRD19PQ9H560 264 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 EXO5Q9H790 373 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 MED17Q9NVC6 651 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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CTDNEP1-204ENST00000570484 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.99□□□□□ -1.45
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CTDNEP1-204ENST00000570484 A0A1B0GX12 115 aa5.98□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.98□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.98□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 GJE1A6NN92 205 aa5.98□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 C17orf51A8MQB3 221 aa5.98□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 H3BNX3 289 aa5.98□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 J3KTA2 159 aa5.98□□□□□ -1.45
CTDNEP1-204ENST00000570484 TNFRSF11BO00300 401 aa5.98□□□□□ -1.45
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