RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 DSN1Q9H410 356 aa14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 WDR45Q9Y484 360 aa14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.97□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 A0A1W2PQD3 144 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 EVPLLA8MZ36 301 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 SCDO00767 359 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 NDUFAB1O14561 156 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 FCMRO60667 390 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 H6PDO95479 791 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 LY6G6DO95868 133 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 NPPAP01160 153 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 BCHEP06276 602 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 CRHP06850 196 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 NUDT7P0C024 238 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 GPX2P18283 190 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 FPR1P21462 350 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 DPP4P27487 766 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 STARP49675 285 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 GPAT3Q53EU6 434 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 MARCH3Q86UD3 253 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 FADS6Q8N9I5 356 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 ZNF527Q8NB42 609 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 OR2M3Q8NG83 312 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 LRRC58Q96CX6 371 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 MKLN1Q9UL63 735 aa14.96□□□□□ -0.01
NEK9-211ENST00000557673 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 A0A1W2PPR1 153 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 MSTNO14793 375 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 ZIC3O60481 467 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 ANGPTL1O95841 491 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 ARAFP10398 606 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 NR2F1P10589 423 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 ATP12AP54707 1039 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 GPR68Q15743 365 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CD226Q15762 336 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 ZNF141Q15928 474 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 OR2A2Q6IF42 318 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 GATSQ8NAP1 163 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 TMEM19Q96HH6 336 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 MED11Q9P086 117 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.95□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 UGT2B17O75795 530 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 TFPTP0C1Z6 253 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 HPGDP15428 266 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CPOXP36551 454 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 LHX2P50458 406 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CRISP3P54108 245 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CHRNEQ04844 493 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 KLHL26Q53HC5 615 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 RABL3Q5HYI8 236 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 MISPQ8IVT2 679 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 MAL2Q969L2 176 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 GID8Q9NWU2 228 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 CALML5Q9NZT1 146 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 ARID1AO14497 2285 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 A0A1W2PNV4 684 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 TMEM247A6NEH6 219 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 H7C1Q1 480 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 AIM2O14862 343 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK9-211ENST00000557673 NDUFB5O43674 189 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms