RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	GGT1	P19440	569 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	HPCAL1	P37235	193 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	CCT5	P48643	541 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	CCR4	P51679	360 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	NUDT6	P53370	316 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	PTGR1	Q14914	329 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	NRF1	Q16656	503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5W2	Q8NH69	310 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	HTRA1	Q92743	480 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR7D2	Q96RA2	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM234B	A2RU67	622 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	PIP5K1B	O14986	540 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	RAD51D	O75771	328 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	C6orf47	O95873	294 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	CHEK2	O96017	543 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM157C	P0CG43	387 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	UBL4A	P11441	157 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	DIO1	P49895	249 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	SKP2	Q13309	424 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	CBFB	Q13951	182 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	AGAP6	Q5VW22	663 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	IFT20	Q8IY31	132 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	SDF2	Q99470	211 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf50	Q9BV19	199 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PR80	420 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	COPE	O14579	308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJA2	O60884	412 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	TTK	P33981	857 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF83	P51522	516 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	SESN3	P58005	492 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	XKR7	Q5GH72	579 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF525	Q8N782	197 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	AGR3	Q8TD06	166 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	SFXN5	Q8TD22	340 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	TRMO	Q9BU70	441 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM114	B3SHH9	223 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	FCMR	O60667	390 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM13	O60858	407 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	PEX11A	O75192	247 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP7B1	O75881	506 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	FGF4	P08620	206 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT16	P08779	473 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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