RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	GADD45G	O95257	159 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	BAG2	O95816	211 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF17	P17021	662 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	CXCR1	P25024	350 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	HTR2A	P28223	471 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	RRM2	P31350	389 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SLC1A3	P43003	542 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEA2	P43356	314 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGDIA	P52565	204 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SESN3	P58005	492 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PMP22	Q01453	160 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	FOXO1	Q12778	655 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	KLRB1	Q12918	225 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	FOXF1	Q12946	379 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TRAM2	Q15035	370 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	FGD3	Q5JSP0	725 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ULK3	Q6PHR2	472 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	RRM2B	Q7LG56	351 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T29	Q8NH02	315 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	C7orf34	Q96L11	122 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	BDH2	Q9BUT1	245 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	LUZP4	Q9P127	313 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	RHCG	Q9UBD6	479 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	STOML1	Q9UBI4	398 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0B4J2E0	115 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GWA3	101 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GX12	115 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ADAM10	O14672	748 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TPST2	O60704	377 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	KRT36	O76013	467 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	LDLR	P01130	860 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	THRB	P10828	461 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PNMT	P11086	282 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PRKCA	P17252	672 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TACR3	P29371	465 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEA5	P43359	124 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	CDH12	P55289	794 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	COLEC12	Q5KU26	742 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SLC38A4	Q969I6	547 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	NTNG2	Q96CW9	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	MPP4	Q96JB8	637 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SFXN2	Q96NB2	322 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	TNFRSF11B	O00300	401 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	CLOCK	O15516	846 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ADAM11	O75078	769 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ELK4	P28324	431 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	ADH6	P28332	368 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	SELENBP1	Q13228	472 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	LY6D	Q14210	128 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDB1-223	ENST00000543658	GK3P	Q14409	553 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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