RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-202ENST00000542324 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-202ENST00000542324 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-202ENST00000542324 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-202ENST00000542324 ZNF879B4DU55 563 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 K7ESM1 405 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TSPAN4O14817 238 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 GPRIN2O60269 458 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RGS11O94810 467 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 NTN1O95631 604 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 FGF19O95750 216 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 AIFM1O95831 613 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 C6P13671 934 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZNF3P17036 446 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CXCL2P19875 107 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZNF136P52737 540 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CAP1Q01518 475 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 22.2
CS-202ENST00000542324 DUSP8Q13202 625 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CDK5R1Q15078 307 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 THAP4Q8WY91 577 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SMPDL3BQ92485 455 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PTP4A1Q93096 173 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LINC00052Q96N35 136 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MTG2Q9H4K7 406 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MED20Q9H944 212 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SCML1Q9UN30 329 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 A0A1B0GW55 424 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ANTXRLA6NF34 631 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 NDUFA2O43678 99 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LILRB3O75022 631 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RP2O75695 350 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LYPD3O95274 346 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 IFNGP01579 166 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ALDOBP05062 364 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 NMBP08949 121 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 FGF2P09038 288 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CLTBP09497 229 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PPP3CBP16298 524 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LAG3P18627 525 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DRD5P21918 477 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PSMB5P28074 263 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MC3RP41968 323 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 GDI2P50395 445 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PDX1P52945 283 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DUSP2Q05923 314 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 METRNLQ641Q3 311 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZNF626Q68DY1 528 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 Q6ZTK2 550 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CDK20Q8IZL9 346 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 BMPERQ8N8U9 685 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TMIEQ8NEW7 156 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR2L5Q8NG80 312 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TMEM239Q8WW34 195 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms