RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 KCNA7Q96RP8 456 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 EDEM2Q9BV94 578 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 BBS10Q8TAM1 723 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 MALSU1Q96EH3 234 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 LIPJQ5W064 366 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 PXKQ7Z7A4 578 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.67□□□□□ -1.5
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