RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537068.5

SNHG1-204, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SNHG1, Length 629 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-204	ENST00000537068	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068		A0A1W2PP18	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ZNF195	O14628	629 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	CYTIP	O60759	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	RAMP1	O60894	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SEC22B	O75396	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	FGF4	P08620	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	UROS	P10746	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	PRKCA	P17252	672 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SDC1	P18827	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	COX5A	P20674	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ENPP1	P22413	925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ME2	P23368	584 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	EDNRA	P25101	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	RFX3	P48380	749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	PRIM2	P49643	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	DSCR9	P59020	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	DNAJB13	P59910	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	VLDLR	P98155	873 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	PDK3	Q15120	406 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068		Q6ZS46	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	FMO2	Q99518	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	CCT7	Q99832	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	PIGU	Q9H490	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068		A0A1W2PPM1	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	GJE1	A6NN92	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068		E7EQL1	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068		H7C417	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SLC28A1	O00337	649 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-204	ENST00000537068	SCD	O00767	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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