RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	WLS	Q5T9L3	541 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	TRIL	Q7L0X0	811 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SVIL	O95425	2214 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	RYK	P34925	604 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PTGER4	P35408	488 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	RFC3	P40938	356 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	DLX5	P56178	289 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	FLOT2	Q14254	428 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	NRF1	Q16656	503 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CBLN3	Q6UW01	205 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ASRGL1	Q7L266	308 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PYURF	Q96I23	114 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	DNAJC13	O75165	2243 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PRRG2	O14669	202 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ADAM10	O14672	748 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ZIC3	O60481	467 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PDE5A	O76074	875 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	OPN1SW	P03999	348 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	THRB	P10828	461 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	GABRA1	P14867	456 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	NCK1	P16333	377 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PRKCA	P17252	672 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CXCR1	P25024	350 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PTGS2	P35354	604 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	MLLT10	P55197	1068 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SESN3	P58005	492 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SMIM11A	P58511	58 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	RAC1	P63000	192 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CARM1	Q86X55	608 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TPST1	O60507	370 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	GPI	P06744	558 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ABO	P16442	354 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	MERTK	Q12866	999 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	CADM2	Q8N3J6	435 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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