RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRG2BQ96QU4 278 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CITED1Q99966 193 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM5Q9C035 493 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHOJQ9H4E5 214 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MALT1Q9UDY8 824 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPN4Q9UHM6 478 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM129A0AVI4 362 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 J3QLI3 93 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UPK1AO00322 258 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OIP5O43482 229 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPANK1O95872 356 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GFAPP14136 432 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STMN1P16949 149 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CALCRP30988 508 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP10-3P60369 221 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBA1BP68363 451 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBA4AP68366 448 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAAAQ02083 359 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF117Q03924 483 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC29A2Q14542 456 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBLN3Q6UW01 205 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASP12Q6UXS9 341 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBA1AQ71U36 451 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF527Q8NB42 609 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYT14Q8NB59 555 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YIPF5Q969M3 257 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF524Q96C55 264 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GUCA1BQ9UMX6 200 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOT9Q9Y305 439 aa8.77□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSTM5A8MXK1 200 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NR5A2O00482 541 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCDO00767 359 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGDHO60701 494 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H6PDO95479 791 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FSHBP01225 129 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACHEP22303 614 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GP5P40197 560 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIO1P49895 249 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TGFBR3Q03167 851 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HGFACQ04756 655 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DLG1Q12959 904 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.76□□□□□ -1.01
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAPH1Q70E73 1250 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RDH5Q92781 318 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BEX1Q9HBH7 125 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF716A6NP11 495 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDLIM1O00151 329 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULT2B1O00204 365 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7A17O14581 309 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIP5K1BO14986 540 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC14BO60729 498 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDYNP01213 254 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CECR9P0C854 216 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKCAP17252 672 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNG1P51959 295 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM33P57088 247 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOXL3P58215 753 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCN2P80188 198 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENBP1Q13228 472 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAF9Q16594 264 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.75□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNJQ5T5M9 372 aa8.75□□□□□ -1.01
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