RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TCF23Q7RTU1 214 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 VN1R4Q7Z5H5 301 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SNX20Q7Z614 316 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRUNE1Q86TP1 453 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CACUL1Q86Y37 369 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MFSD6LQ8IWD5 586 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TPH2Q8IWU9 490 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MCEMP1Q8IX19 187 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF101Q8IZC7 436 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 POMGNT2Q8NAT1 580 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR9A4Q8NGU2 314 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C15orf40Q8WUR7 153 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TCP11Q8WWU5 503 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PATE1Q8WXA2 126 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR5P3Q8WZ94 311 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AKR1E2Q96JD6 320 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SFXN2Q96NB2 322 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZFP3Q96NJ6 502 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GPA33Q99795 319 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DESI2Q9BSY9 194 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CHIAQ9BZP6 476 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MUC13Q9H3R2 512 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LRRC19Q9H756 370 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCL28Q9NRJ3 127 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PCYOX1Q9UHG3 505 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 VAX2Q9UIW0 290 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMCC3Q9ULS5 477 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 L3MBTL1Q9Y468 752 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OARD1Q9Y530 152 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TET1Q8NFU7 2136 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OTOFQ9HC10 1997 aa-1.28□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CHD8Q9HCK8 2581 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A0U1RQV1 116 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A1W2PQF6 199 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HELTA6NFD8 242 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LGALS16A8MUM7 142 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 K7ERI5 159 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PEX7O00628 323 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MEIS2O14770 477 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC22A1O15245 554 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC31A1O15431 190 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADAM20O43506 726 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SH3BP5O60239 455 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CSO75390 466 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SCRG1O75711 98 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 YIF1AO95070 293 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ETHE1O95571 254 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HLA-DQB1P01920 261 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SERPING1P05155 500 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PGK2P07205 417 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CD55P08174 381 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC35G4P0C7Q5 338 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GHRP10912 638 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IMPDH1P20839 514 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TNFSF4P23510 183 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ABCD1P33897 745 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CRKLP46109 303 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GYG1P46976 350 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAPK12P53778 367 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ACTR2P61160 394 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PPP1CBP62140 327 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UBXN2AP68543 259 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SIRPAP78324 504 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IL1RL1Q01638 556 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NIPAL4Q0D2K0 466 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BECN1Q14457 450 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KCNJ11Q14654 390 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RALBP1Q15311 655 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANKRD1Q15327 319 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DPCR1Q3MIW9 517 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMUG1Q53HV7 270 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LRRC10Q5BKY1 277 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM209BQ5JX69 171 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 WDR45BQ5MNZ6 344 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IZUMO3Q5VZ72 239 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRR27Q6MZM9 219 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MED27Q6P2C8 311 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TTC27Q6P3X3 843 aa-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms