RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAMP1O60894 148 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 RHOBTB1O94844 696 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 CSH1P0DML2 217 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 CSH2P0DML3 217 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGHV1-8P0DP01 117 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 DPP4P27487 766 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 REG3AQ06141 175 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC10A7Q0GE19 358 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 FUT5Q11128 374 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM53BQ14153 422 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 NFE2L1Q14494 772 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 BOLA3Q53S33 107 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 C1orf100Q5SVJ3 147 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 BPIFB2Q8N4F0 458 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR51S1Q8NGJ8 323 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM110BQ8TC76 370 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 ULK4Q96C45 1275 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF382Q96SR6 550 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 RETNLBQ9BQ08 111 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 ATG101Q9BSB4 218 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 LMAN1LQ9HAT1 526 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 HMG20AQ9NP66 347 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 HAUS2Q9NVX0 235 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 ATP6V1HQ9UI12 483 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 TEKT2Q9UIF3 430 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM120BA0PK00 339 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF860A6NHJ4 632 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR6C70A6NIJ9 312 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 A8MUI8 341 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM86B1E9PN63 330 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 K7EMT4 169 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 TSPAN9O75954 239 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM86B2P0C5J1 330 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRPS2P11908 318 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 CNR1P21554 472 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 OMGP23515 440 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 UQCRFS1P47985 274 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 KCNK10P57789 538 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 ASPHQ12797 758 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 IFT88Q13099 833 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 MYO9BQ13459 2157 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC39A12Q504Y0 691 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 CCDC30Q5VVM6 783 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLX4IPQ5VYV7 408 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 PNCKQ6P2M8 343 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 IPMKQ8NFU5 416 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR6C4Q8NGE1 309 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 LINC01560Q8TB33 94 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 FCRL1Q96LA6 429 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 PGLYRP4Q96LB8 373 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 RASL10BQ96S79 203 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 CAMK2N2Q96S95 79 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 INPP5KQ9BT40 448 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC25A51Q9H1U9 297 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 MIS18AQ9NYP9 233 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 APPL1Q9UKG1 709 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 USP16Q9Y5T5 823 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 R4GN34 69 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 GBF1Q92538 1859 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 A0A1B0GVI7 797 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 A6NCN8 305 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 JCHAINP01591 159 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 GSTA1P08263 222 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 B4GALT1P15291 398 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 EMP2P54851 167 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 DCAF7P61962 342 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 CCDC173Q0VFZ6 552 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 NPRL3Q12980 569 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPIL2Q13356 520 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 PTK6Q13882 451 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 KARSQ15046 597 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM78AQ5JUQ0 283 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZFP1Q6P2D0 407 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 CPXCR1Q8N123 301 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 POMGNT2Q8NAT1 580 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR4F15Q8NGB8 312 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms