RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.81□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 NINQ8N4C6 2090 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 ZNF195O14628 629 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 DPM1O60762 260 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 GUCY1B2O75343 617 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 ZFAND5O76080 213 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 OR6B1O95007 311 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 IGKV3-11P04433 115 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 S1PR1P21453 382 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 RFC3P40938 356 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 SOX2P48431 317 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.329e-18■■■□□ 16.4
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UBE2B-204ENST00000504431 OR1C1Q15619 314 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 MEP1AQ16819 746 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM107Q6UX40 140 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 MORN4Q8NDC4 146 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 FCRL1Q96LA6 429 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.8□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 OR52B2Q96RD2 323 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 DYTNA2CJ06 578 aa6.79□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.79□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.79□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.79□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 Q6ZS92 163 aa6.79□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM156Q8N614 296 aa6.79□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.79□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.79□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 TEX37Q96LM6 180 aa6.79□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.79□□□□□ -1.32
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UBE2B-204ENST00000504431 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.79□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 HAO1Q9UJM8 370 aa6.79□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 PSME2Q9UL46 239 aa6.79□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.79□□□□□ -1.32
UBE2B-204ENST00000504431 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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