RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495141.5

UBE2E1-211, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2E1, Length 582 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-211ENST00000495141 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TRAPPC6AO75865 159 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PRKCAP17252 672 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 HTR3AP46098 478 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CCR4P51679 360 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 MAP2K6P52564 334 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GFRA1P56159 465 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SELENOWP63302 87 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RBPJQ06330 500 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 QPRTQ15274 297 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GLYATQ6IB77 296 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 AAGABQ6PD74 315 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CBLL1Q75N03 491 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SARAFQ96BY9 339 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ASB9Q96DX5 294 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 LDAHQ9H6V9 325 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 STOML1Q9UBI4 398 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 BCKDKO14874 412 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ARPC2O15144 300 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TPST1O60507 370 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CYP7B1O75881 506 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 NUDT14O95848 222 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 EPPINO95925 133 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 FESP07332 822 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CELA3AP09093 270 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RIPPLY3P57055 190 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 NCALDP61601 193 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TOMM20Q15388 145 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 BCL2A1Q16548 175 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 DUSP7Q16829 419 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 LCN8Q6JVE9 175 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ARSKQ6UWY0 536 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GRINAQ7Z429 371 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RNF148Q8N7C7 305 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PROX1Q92786 737 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 FAM162AQ96A26 154 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SFXN2Q96NB2 322 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ZNF559Q9BR84 538 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 THTPAQ9BU02 230 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 C12orf10Q9HB07 376 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RLIMQ9NVW2 624 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 OR2M5A3KFT3 312 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GSC2O15499 205 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 OPN1SWP03999 348 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SLC1A3P43003 542 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ZNF136P52737 540 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 COPZ1P61923 177 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RAET1LQ5VY80 246 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 VASNQ6EMK4 673 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GFRALQ6UXV0 394 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SMYD1Q8NB12 490 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TRIM2Q9C040 744 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 VDAC3Q9Y277 283 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ADAM11O75078 769 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms