RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262		C9JVG2	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262		H0YIV9	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262		H0YJX3	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262		K7EQS6	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	INPP4B	O15327	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	C1orf105	O95561	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	PMS2P2	O95744	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	BAG2	O95816	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	GBA	P04062	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	UMPS	P11172	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	ERG	P11308	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	BCKDHA	P12694	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	ITGA2	P17301	1181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CD22	P20273	847 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	PDHA2	P29803	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	GDI1	P31150	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	HNF4A	P41235	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	GSK3B	P49841	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	ERF	P50548	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	MMP15	P51511	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	BMX	P51813	675 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CAPZA1	P52907	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	NME5	P56597	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	ABR	Q12979	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	RPA4	Q13156	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CHIT1	Q13231	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CST6	Q15828	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	MEP1B	Q16820	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	IMPG1	Q17R60	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	LIX1	Q8N485	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	GTF2H4	Q92759	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	FGF14	Q92915	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	TESC	Q96BS2	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	HBEGF	Q99075	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	PKP4	Q99569	1192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CEP290	O15078	2479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-223	ENST00000492262		E7EQ34	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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