RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ATG9BQ674R7 924 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DDA1Q9BW61 102 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MND1Q9BWT6 205 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DERL2Q9GZP9 239 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C5orf52A6NGY3 159 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 UBE2CO00762 179 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PDCD5O14737 125 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CRCPO75575 148 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 UBXN7O94888 489 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PIRTP0C851 137 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PRSS56P0CW18 603 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 UROSP10746 265 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MTHFD2P13995 350 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CAPZBP47756 277 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ECH1Q13011 328 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PLA1AQ53H76 456 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 KLHL26Q53HC5 615 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 WDR20Q8TBZ3 569 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SGPP1Q9BX95 441 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR2AG1Q9H205 316 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C1orf109Q9NX04 203 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PPT2Q9UMR5 302 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GAB2Q9UQC2 676 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 D6RAR5 112 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TEX46H3BTG2 121 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC28A1O00337 649 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GPR39O43194 453 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CDRT1O95170 752 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C1orf105O95561 183 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CYC1P08574 325 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CD1DP15813 335 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DNASE1P24855 282 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CD82P27701 267 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CSF2RBP32927 897 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PPP3R1P63098 170 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RNF44Q7L0R7 432 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 AMZ2Q86W34 360 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DEFB119Q8N690 84 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ELP5Q8TE02 316 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RSC1A1Q92681 617 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SFXN2Q96NB2 322 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LRFN5Q96NI6 719 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC32A1Q9H598 525 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.11□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.11□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 ISM1B1AKI9 464 aa7.11□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 DPM1O60762 260 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NR2C1P13056 603 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CXCL3P19876 107 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CDKN2DP55273 166 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 Q8NFD4 153 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.11□□□□□ -1.27
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