RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 DTX2Q86UW9 622 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC43A2Q8N370 569 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF527Q8NB42 609 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR119Q8TDV5 335 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP90Q8TF47 636 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM168AQ92567 244 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 STACQ99469 402 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PIGUQ9H490 435 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 BCO1Q9HAY6 547 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OXSMQ9NWU1 459 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS50Q9UI38 385 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PNR3 127 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM233B4DJY2 109 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 C9JVG2 144 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BNH8 94 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 LY6HO94772 140 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 H6PDO95479 791 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 FESP07332 822 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00032P0C843 101 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 LAMP1P11279 417 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CPA3P15088 417 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC7A1P30825 629 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CRHR1P34998 444 aa8.31□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 ASMTP46597 345 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 P2RX1P51575 399 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 DSCR9P59020 149 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 RAC3P60763 192 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SELENBP1Q13228 472 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GGTLC2Q14390 218 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 MLC1Q15049 377 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PPA1Q15181 289 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC153Q494R4 210 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GALNTL6Q49A17 601 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 LIPMQ5VYY2 423 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CDC73Q6P1J9 531 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC63Q8NA47 563 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 C3orf49Q96BT1 292 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 MTERF3Q96E29 417 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 PRR14Q9BWN1 585 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.31□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.31□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCD4O14678 606 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TMPRSS2O15393 492 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CYTIPO60759 359 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 COX5AP20674 150 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CCT5P48643 541 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CCR4P51679 360 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP12AP54707 1039 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TP53BP2Q13625 1128 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 QPRTQ15274 297 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 DCST2Q5T1A1 773 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 KANK2Q63ZY3 851 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf107Q8IVU9 208 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 DDIASQ8IXT1 998 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 IFT20Q8IY31 132 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CNPY4Q8N129 248 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF614Q8N883 585 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR56A1Q8NGH5 318 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5W2Q8NH69 310 aa8.3□□□□□ -1.08
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