RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 OR2A2Q6IF42 318 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 OSTF1Q92882 214 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 RNF122Q9H9V4 155 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 SAR1AQ9NR31 198 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ACER3Q9NUN7 267 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 NOTCH2Q04721 2471 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PNV4 684 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CRHP06850 196 aa18.79■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 PDSS1Q5T2R2 415 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 GCNT6Q5T4J0 391 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 HBMQ6B0K9 141 aa18.79■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 MCEMP1Q8IX19 187 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa18.79■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 TRIM8Q9BZR9 551 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CHST2Q9Y4C5 530 aa18.79■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 AP3D1O14617 1153 aa18.78■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 LIN52Q52LA3 116 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.78■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CENPEQ02224 2701 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 NAV2Q8IVL1 2488 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CDHR4A6H8M9 788 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa18.77■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 THBS1P07996 1170 aa18.77■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 BBS10Q8TAM1 723 aa18.77■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 CTPS2Q9NRF8 586 aa18.77■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 SERINC1Q9NRX5 453 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ZNF232Q9UNY5 417 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 IFT52Q9Y366 437 aa18.76■□□□□ 0.59
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ACTB-211ENST00000480301 CFAP73A6NFT4 308 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SYNGR4O95473 234 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GKN3PP0CG01 181 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ETS2P15036 469 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 MTPNP58546 118 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
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