RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 NINJ1Q92982 152 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 MARK4Q96L34 752 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 KLHL15Q96M94 604 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PANX1Q96RD7 426 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 C12orf49Q9H741 205 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PROCRQ9UNN8 238 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 USF3Q68DE3 2245 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PNR3 127 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SERINC4A6NH21 518 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CCDC154A6NI56 674 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CLDN24A6NM45 220 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 C16orf97H3BN30 126 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 RFXANKO14593 260 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SLC22A2O15244 555 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZNF264O43296 627 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SYNGR4O95473 234 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 KRT75O95678 551 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GSNP06396 782 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 THBDP07204 575 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CCR4P51679 360 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 QPRTQ15274 297 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZNF141Q15928 474 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SAXO2Q658L1 398 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZNF527Q8NB42 609 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 OR5W2Q8NH69 310 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PIK3IP1Q96FE7 263 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 MED18Q9BUE0 208 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 RAD21L1Q9H4I0 556 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SLC6A13Q9NSD5 602 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 STOML1Q9UBI4 398 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GMNCA6NCL1 334 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 H3BNH8 94 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CCDC22O60826 627 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 STX11O75558 287 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ANP32DO95626 131 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 RAF1P04049 648 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 UBL4AP11441 157 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CD53P19397 219 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ENPP1P22413 925 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ME2P23368 584 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 LOXP28300 417 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 LSP1P33241 339 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CTBP2P56545 445 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ADAM8P78325 824 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PLAURQ03405 335 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SKP2Q13309 424 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 KEAP1Q14145 624 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 MAPRE2Q15555 327 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 TSC22D1Q15714 1073 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 AGKQ53H12 422 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 COX20Q5RI15 118 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 RNF130Q86XS8 419 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ROPN1LQ96C74 230 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SPDL1Q96EA4 605 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 NEURL3Q96EH8 262 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SLC35A5Q9BS91 424 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZNF385DQ9H6B1 395 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 EXD2Q9NVH0 621 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PP18 115 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 HMGN4O00479 90 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms