RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 MED23Q9ULK4 1368 aa2.65□□□□□ -1.98
RABGGTB-206ENST00000467748 LOC285556D6RIA3 1793 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 MACROD2A1Z1Q3 448 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 LRIT2A6NDA9 550 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC69A6NI79 296 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 F5H6K3 240 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 BUB1O43683 1085 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 HSF2BPO75031 334 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 IGLV1-47P01700 117 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF32P17041 273 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TMOD1P28289 359 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 UGT1A3P35503 534 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ACVR1BP36896 505 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC26A2P50443 739 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 DIO3P55073 304 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 UCNP55089 124 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 GNB2P62879 340 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT83P78385 493 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 NME3Q13232 169 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CARTPTQ16568 116 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TFAP2EQ6VUC0 442 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 UNC45BQ8IWX7 931 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CENPSQ8N2Z9 138 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM45BQ96B21 275 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 DPH7Q9BTV6 452 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TSSK1BQ9BXA7 367 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM4Q9C037 500 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM107BQ9H098 131 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 PORCNQ9H237 461 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNMB3Q9NPA1 279 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ELOVL2Q9NXB9 296 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM153AQ9UHL3 310 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ASXL3Q9C0F0 2248 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CTAGE5O15320 804 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 SDC3O75056 442 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ASGR1P07306 291 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TPM1P09493 284 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF806P0C7X5 589 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 GNSP15586 552 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 SDC1P18827 310 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHV1-2P23083 117 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 STK19P49842 368 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TPM4P67936 248 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CCNA1P78396 465 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ARF5P84085 180 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 RAB35Q15286 201 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 KYAT1Q16773 422 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 OTPQ5XKR4 325 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 AP1ARQ63HQ0 302 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 GPBP1Q86WP2 473 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC25A38Q96DW6 304 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 VPS39Q96JC1 886 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 IMMP1LQ96LU5 166 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF560Q96MR9 790 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CBWD1Q9BRT8 395 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 EHD1Q9H4M9 534 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 STARD5Q9NSY2 213 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 HMG20BQ9P0W2 317 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 DUSP12Q9UNI6 340 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ARAP2Q8WZ64 1704 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBED9Q6R2W3 1325 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 UBR2Q8IWV8 1755 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 SIP14410 1827 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ECM29Q5VYK3 1845 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 NID2Q14112 1375 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 AKAP13Q12802 2813 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA6L10A6NI86 522 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 B4DXG7 233 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 TLR4O00206 839 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 WWP2O00308 870 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 OR7A17O14581 309 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 GOSR1O95249 250 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 IVLP07476 585 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 HMOX1P09601 288 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF17P17021 662 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 OR3A4PP47883 348 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 CCL11P51671 97 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 EFNA3P52797 238 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 DEFB103AP81534 67 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-206ENST00000467748 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms