RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CETN3	O15182	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	STX10	O60499	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TLE4	Q04727	773 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ABR	Q12979	859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NPRL3	Q12980	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NPTX1	Q15818	432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080		Q6ZS92	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF195	O14628	629 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZW10	O43264	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	YEATS4	O95619	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KLK2	P20151	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	OTX2	P32243	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MTCP1	P56278	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RAD51	Q06609	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IHH	Q14623	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SHC3	Q92529	594 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NRTN	Q99748	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SPX	Q9BT56	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LIME1	Q9H400	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CUBN	O60494	3623 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ANK2	Q01484	3957 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1W2PPK0	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1W2PPW3	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080		H7C423	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CCL21	O00585	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SCRG1	O75711	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	F3	P13726	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CD1E	P15812	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	LBP	P18428	481 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PSMB4	P28070	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	RORA	P35398	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	GPR1	P46091	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	NDUFA8	P51970	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IST1	P53990	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms