RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TUBAL3A6NHL2 446 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ENO4A6NNW6 628 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C5orf58C9J3I9 102 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MSTNO14793 375 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNFSF13O75888 250 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VIMP08670 466 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SESN3P58005 492 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SORDQ00796 357 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC25A53Q5H9E4 307 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM200AQ86VY9 491 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZZZ3Q8IYH5 903 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC38A5Q8WUX1 472 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARMC7Q9H6L4 198 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GLRX2Q9NS18 164 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACER3Q9NUN7 267 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CORO2BQ9UQ03 480 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A0A1W2PP18 115 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANGPT2O15123 496 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AQP8O94778 261 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NTN1O95631 604 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NID1P14543 1247 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAPN3P20807 821 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MVDP53602 400 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGNQ15493 299 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LIN52Q52LA3 116 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 METTL21CQ5VZV1 264 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VWA1Q6PCB0 445 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM214BQ7L5A3 538 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM222BQ8WU58 562 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STARD4Q96DR4 205 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LURAP1Q96LR2 239 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC39A3Q9BRY0 314 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRGBPQ9NV56 204 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALNT8Q9NY28 637 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRIM1Q9NZV1 1036 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PROCRQ9UNN8 238 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF232Q9UNY5 417 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO9AB2RTY4 2548 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TACC2O95359 2948 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A0A0G2JPF8 293 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLDN24A6NM45 220 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A8MXE2 369 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EVPLLA8MZ36 301 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJA2O60884 412 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TFPTP0C1Z6 253 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SHC1P29353 583 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNJ5P48544 419 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRIF1Q5T3J3 769 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BTLAQ7Z6A9 289 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF440Q8IYI8 595 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR52P1PQ8NH57 321 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM19Q96HH6 336 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR5B2Q96R09 309 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBN2P35556 2912 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CREBBPQ92793 2442 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CFAP73A6NFT4 308 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EFNA2O43921 213 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TFPIP10646 304 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HTR3AP46098 478 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IDH2P48735 452 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZSWIM7Q19AV6 140 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAGE3Q5JUK9 113 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GCNT6Q5T4J0 391 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXW10Q5XX13 1052 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRINAQ7Z429 371 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A4GALTQ9NPC4 353 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLEC4AQ9UMR7 237 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NDUFAF1Q9Y375 327 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MED12LQ86YW9 2145 aa17.71■□□□□ 0.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CD8BP10966 210 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARFIP2P53365 341 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GUCY1A3Q02108 690 aa17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms