RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 WDR45Q9Y484 360 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM120BA0PK00 339 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SDHDO14521 159 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SIAH2O43255 324 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLF4O43474 513 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CYP7B1O75881 506 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 IL6P05231 212 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PGRP06401 933 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 THBDP07204 575 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ENPP1P22413 925 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 AGTR1P30556 359 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PGM1P36871 562 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KHKP50053 298 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NR1H2P55055 460 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CASP9P55211 416 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KCNJ10P78508 379 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SKP2Q13309 424 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 P2RY6Q15077 328 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MAPK14Q16539 360 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 GPAT3Q53EU6 434 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 BEX5Q5H9J7 111 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF550Q7Z398 422 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 HSD17B8Q92506 261 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RAB8BQ92930 207 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF524Q96C55 264 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZG16BQ96DA0 208 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TEX37Q96LM6 180 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OR52E6Q96RD3 313 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PANX1Q96RD7 426 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZBTB18Q99592 522 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 BCO1Q9HAY6 547 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 AIG1Q9NVV5 245 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PLCE1Q9P212 2302 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NF1P21359 2839 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PNR3 127 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF724A8MTY0 619 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SULT2B1O00204 365 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 HMGN4O00479 90 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLF11O14901 512 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KIAA0513O60268 411 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CYTIPO60759 359 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SMPD2O60906 423 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMCC2O75069 709 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A3O75751 556 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KRT75O95678 551 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KITP10721 976 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 IDO1P14902 403 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 EPHA3P29320 983 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 IL12AP29459 219 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CCKARP32238 428 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 HTR3AP46098 478 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CCR4P51679 360 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MAP2K6P52564 334 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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