RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 CASP9P55211 416 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 RAC3P60763 192 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 SPOCK1Q08629 439 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 P2RY6Q15077 328 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 ETFDHQ16134 617 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.62□□□□□ -0.07
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VARS-216ENST00000428445 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.62□□□□□ -0.07
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VARS-216ENST00000428445 KRT16P08779 473 aa14.61□□□□□ -0.07
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VARS-216ENST00000428445 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 SLC43A2Q8N370 569 aa14.61□□□□□ -0.07
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VARS-216ENST00000428445 SERINC4A6NH21 518 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 PGM3O95394 542 aa14.58□□□□□ -0.08
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