RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 DCST2Q5T1A1 773 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 FBXL6Q8N531 539 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 OR2T27Q8NH04 317 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 KAT2AQ92830 837 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SMIM19Q96E16 107 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SORCS2Q96PQ0 1159 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF426Q9BUY5 554 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 IFT27Q9BW83 186 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CACNG6Q9BXT2 260 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 XKR8Q9H6D3 395 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 LEUTXA8MZ59 168 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 AKR7A2O43488 359 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CEACAM5P06731 702 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 H2AFB2P0C5Z0 115 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CPMP14384 443 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 NT5EP21589 574 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 MNDAP41218 407 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 RAB8AP61006 207 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF85Q03923 595 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 DUSP5Q16690 384 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CEP78Q5JTW2 689 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CLLU1Q5K131 121 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 MANEAQ5SRI9 462 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 UTS2BQ765I0 119 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 POF1BQ8WVV4 589 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ING5Q8WYH8 240 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SMPDL3BQ92485 455 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SMARCD2Q92925 531 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 PTP4A1Q93096 173 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ABHD1Q96SE0 405 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM2Q9C040 744 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 FAM183AA6NL82 134 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 LANCL1O43813 399 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 REM1O75628 298 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 EPXP11678 715 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 PRG2P13727 222 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 EPCAMP16422 314 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 MAKP20794 623 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 HTR2AP28223 471 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CTNNB1P35222 781 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 MAP3K8P41279 467 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CDK5R1Q15078 307 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 LTB4RQ15722 352 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CDONQ4KMG0 1287 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ABHD13Q7L211 337 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CAMKVQ8NCB2 501 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 C4orf36Q96KX1 117 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0C4DFX4 3053 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0B4J2E0 115 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GX12 115 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ICMTO60725 284 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 TFPIP10646 304 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 DRD5P21918 477 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ITGB8P26012 769 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SCAND1P57086 179 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 SGCGQ13326 291 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 IL10RAQ13651 578 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 INSL4Q14641 139 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 GSG1Q2KHT4 349 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 C11orf74Q86VG3 221 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF527Q8NB42 609 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 OR11H7Q8NGC8 314 aa15.58■□□□□ 0.09
HCLS1-202ENST00000428394 RPS4Y2Q8TD47 263 aa15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms