RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FUNDC1Q8IVP5 155 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACBD4Q8NC06 268 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR52P1PQ8NH57 321 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZG16BQ96DA0 208 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NPAS1Q99742 590 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MCCC2Q9HCC0 563 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FANCFQ9NPI8 374 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GLRX2Q9NS18 164 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC6A13Q9NSD5 602 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACER3Q9NUN7 267 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PROCRQ9UNN8 238 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0G2JPF8 293 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP8B1O43520 1251 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNFSF13O75888 250 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TFPTP0C1Z6 253 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TFPIP10646 304 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NID1P14543 1247 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAPN3P20807 821 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL11P20809 199 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HTR3AP46098 478 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARFIP2P53365 341 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COPZ1P61923 177 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SORDQ00796 357 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRINAQ7Z429 371 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STK32CQ86UX6 486 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM222BQ8WU58 562 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC38A5Q8WUX1 472 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM19Q96HH6 336 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR5B2Q96R09 309 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLHDC3Q9BQ90 382 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 JKAMPQ9P055 326 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFT52Q9Y366 437 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCA12Q86UK0 2595 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFAP73A6NFT4 308 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLDN24A6NM45 220 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A8MXE2 369 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CASKO14936 926 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AQP8O94778 261 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VWA1Q6PCB0 445 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF550Q7Z398 422 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BTLAQ7Z6A9 289 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRT73Q86Y46 540 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC43A2Q8N370 569 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BBS10Q8TAM1 723 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ROBO4Q8WZ75 1007 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STARD4Q96DR4 205 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADGRG7Q96K78 797 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LURAP1Q96LR2 239 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GALNT8Q9NY28 637 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CREBBPQ92793 2442 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MPDZO75970 2070 aa11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A1W2PNR3 127 aa11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SULT2B1O00204 365 aa11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EFNA2O43921 213 aa11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAJA2O60884 412 aa11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRKD3O94806 890 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms