RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 SSR1P43307 286 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 BRCC3P46736 316 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CASP4P49662 377 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 EMDP50402 254 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 TPMTP51580 245 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 C21orf59P57076 290 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 RPS15P62841 145 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 LTB4RQ15722 352 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CHI3L2Q15782 390 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 STK11Q15831 433 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CNPY1Q3B7I2 92 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 XKR7Q5GH72 579 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 RAET1LQ5VY80 246 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SLX4IPQ5VYV7 408 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 OR2A2Q6IF42 318 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 STAC2Q6ZMT1 411 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 LANCL3Q6ZV70 420 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 LUZP2Q86TE4 346 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SLC25A42Q86VD7 318 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 COMMD1Q8N668 190 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CEP112Q8N8E3 955 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 OR6T1Q8NGN1 323 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 OR1F12Q8NHA8 337 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 RFESDQ8TAC1 157 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 TBCKQ8TEA7 893 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 RASL10AQ92737 203 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 TADA1Q96BN2 335 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 C10orf35Q96D05 121 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 HAVCR1Q96D42 359 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 C9orf85Q96MD7 179 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 TSNARE1Q96NA8 513 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 COPS8Q99627 209 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SOSTQ9BQB4 213 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CENPKQ9BS16 269 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 GLT8D2Q9H1C3 349 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM185BQ9H7F4 350 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 ANKRA2Q9H9E1 313 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 GCNT4Q9P109 453 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 GALPQ9UBC7 116 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF639Q9UID6 485 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CA5BQ9Y2D0 317 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 STK38LQ9Y2H1 464 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 NTNG1Q9Y2I2 539 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 MEMO1Q9Y316 297 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 FRMPD3Q5JV73 1810 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SRRM5B3KS81 715 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 OR7A17O14581 309 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 EFNA2O43921 213 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SH3BGRLO75368 114 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 LRATO95237 230 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 KRT6AP02538 564 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 IGF1P05019 195 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 ALOX5P09917 674 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC172P0C7W6 258 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 BCKDHAP12694 445 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 POU2F1P14859 743 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SDC1P18827 310 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 TBXA2RP21731 343 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 HOXD10P28358 340 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SHC1P29353 583 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CASP14P31944 242 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 BMI1P35226 326 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 HPCAL1P37235 193 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 ELK3P41970 407 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 EPS15P42566 896 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 CDKN1BP46527 198 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 OR1D4P47884 311 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 SLC11A1P49279 550 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 NTHL1P78549 312 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 PPP1R3AQ16821 1122 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 MICAQ29983 383 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-207ENST00000418674 KLHL40Q2TBA0 621 aa2.25□□□□□ -2.05
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