RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 TSC22D2O75157 780 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 GYPBP06028 91 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FCN2Q15485 313 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 BICRALQ6AI39 1079 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LNX2Q8N448 690 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL4L1Q8NHW4 92 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD4Q8TB40 342 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF22Q9HCT0 170 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KCMF1Q9P0J7 381 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF11Q9UIL8 331 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNE5Q9UJ90 142 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR19A6NJB7 356 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OR12D2P58182 307 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RUNX2Q13950 521 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 GHDCQ8N2G8 530 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OR13C5Q8NGS8 318 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 BPIFA2Q96DR5 249 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NTMQ9P121 344 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D29Q9UFV1 150 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PPK0 400 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FABP7O15540 132 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35G6P0C7Q6 338 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 IL9P15248 144 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 AHCYP23526 432 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RFX3P48380 749 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NTRK2Q16620 822 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 DCST2Q5T1A1 773 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FIGNL1Q6PIW4 674 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF619Q8N2I2 560 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf57Q8NEG2 295 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CMC2Q9NRP2 79 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT15Q9NV35 164 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNG2Q9Y698 323 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A31A6NKX4 558 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RX6O15547 441 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LDB3O75112 727 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NPR2P20594 1047 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 BTCP35070 178 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 GRHL3Q8TE85 626 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 APOOQ9BUR5 198 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF350Q9GZX5 532 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MED28Q9H204 178 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC72A6NJI9 287 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PLPP2O43688 288 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RCBTB2O95199 551 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 THBS1P07996 1170 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SDHBP21912 280 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS21P63220 83 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SFTPA2Q8IWL1 248 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA7Q8IZY2 2146 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGUQ9H490 435 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0G2JK05 382 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CDHR4A6H8M9 788 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CHP2O43745 196 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 FZD7O75084 574 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SBK2P0C263 348 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CPMP14384 443 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFS1P28331 727 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 BTG1P62324 171 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CRMP1Q14194 572 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO42Q6P3S6 717 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT9Q86SS6 491 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TIGD4Q8IY51 512 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK20Q8IZL9 346 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 COX18Q8N8Q8 333 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 FOLH1BQ9HBA9 442 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPN10Q9HC96 672 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC23A1Q9UHI7 598 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TEKT2Q9UIF3 430 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGLEC7Q9Y286 467 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PRG6 482 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 STX11O75558 287 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 LYPD3O95274 346 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 DBIP07108 87 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 NID1P14543 1247 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PYCR1P32322 319 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 BMP8BP34820 402 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF4P43489 277 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF85Q03923 595 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CREB3L2Q70SY1 520 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 Q7L0L9 218 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms