RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ZNF3P17036 446 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 APEX1P27695 318 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NR4A2P43354 598 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 KIR2DL3P43628 341 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CAV3P56539 151 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ZFP69Q49AA0 526 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 PRSS41Q7RTY9 318 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OR5W2Q8NH69 310 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ENKD1Q9H0I2 346 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SERTAD3Q9UJW9 196 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 IFNGP01579 166 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SBK2P0C263 348 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CT62P0C5K7 136 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 S100A1P23297 94 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A6P31641 620 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 DAB2P98082 770 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 PLAURQ03405 335 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 FIGNL1Q6PIW4 674 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 PLET1Q6UQ28 207 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TRILQ7L0X0 811 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OOSP2Q86WS3 158 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CMIPQ8IY22 773 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TMEM99Q8N816 258 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 DMDP11532 3685 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 GXYLT2A0PJZ3 443 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CD8B2A6NJW9 211 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TTC36A6NLP5 189 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SAGP10523 405 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CD8BP10966 210 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 GABRG2P18507 467 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CCR5P51681 352 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SKP1P63208 163 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TCEA2Q15560 299 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 THSD4Q6ZMP0 1018 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ZNF550Q7Z398 422 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OR13C2Q8NGS9 318 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TTYH2Q9BSA4 534 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 MMP28Q9H239 520 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SEMA6CQ9H3T2 930 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NOX1Q9Y5S8 564 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OR5K3A6NET4 321 aa21.93■■□□□ 1.1
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF141Q15928 474 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TBRG1Q3YBR2 411 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 MS4A15Q8N5U1 240 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OR5T3Q8NGG3 340 aa21.93■■□□□ 1.1
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PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GWA3 101 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SC5DO75845 299 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 FAM157BP0CG42 384 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 PVRP15151 417 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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PMS1-205ENST00000409985 OR52R1Q8NGF1 315 aa21.92■■□□□ 1.1
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PMS1-205ENST00000409985 CD1AP06126 327 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 RFX3P48380 749 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 PSG6Q00889 435 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OAFQ86UD1 273 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OIT3Q8WWZ8 545 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 MED20Q9H944 212 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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