RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINA3P01011 423 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 IFNGP01579 166 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 STOMP27105 288 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA1024LP59773 190 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CAMK2BQ13554 666 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ACSM3Q53FZ2 586 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FCRLBQ6BAA4 426 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DTX3Q8N9I9 347 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 BADQ92934 168 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PHF21AQ96BD5 680 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DIABLOQ9NR28 239 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM74BQ9NUR3 256 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 C5orf42Q9H799 3197 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SLC31A1O15431 190 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PTP4A3O75365 173 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 UBL3O95164 117 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 IFI6P09912 130 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CLUP10909 449 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PEPDP12955 493 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 UGT2B7P16662 529 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NT5EP21589 574 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ACVR1BP36896 505 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 GAS6Q14393 721 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FCN2Q15485 313 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD54Q6NXT1 300 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 RPTNQ6XPR3 784 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 OR5J2Q8NH18 312 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 OR51A7Q8NH64 312 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TTC9Q92623 222 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 GHSRQ92847 366 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 GHITMQ9H3K2 345 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 EMC7Q9NPA0 242 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 COPZ2Q9P299 210 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ING4Q9UNL4 249 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0B4J2E0 115 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GVC2 190 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GX12 115 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF860A6NHJ4 632 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 A6NIN4 97 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FGF17O60258 216 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SLC6A6P31641 620 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PYCR1P32322 319 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PITPNAQ00169 270 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SLC36A2Q495M3 483 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 GRHL3Q8TE85 626 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ABRACLQ9P1F3 81 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 COL4A2P08572 1712 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV6A0A075B6T7 132 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D3LB9A6J9 549 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FABP7O15540 132 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 LDB3O75112 727 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 RFPL3O75679 317 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D3HP0C7X1 549 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K8P41279 467 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 RBM34P42696 430 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MMP15P51511 669 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ACTA2P62736 377 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ACTG2P63267 376 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PLAURQ03405 335 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TCEA2Q15560 299 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PRRT3Q5FWE3 981 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FCRL6Q6DN72 434 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 LYPD8Q6UX82 237 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 RTL4Q6ZR62 310 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TOMM5Q8N4H5 51 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DOK4Q8TEW6 326 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 HSD17B8Q92506 261 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 LRFN5Q96NI6 719 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MAT2BQ9NZL9 334 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 GPR75O95800 540 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DRD5P21918 477 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SEC13P55735 322 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CD276Q5ZPR3 534 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms