RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 TSTD3H0UI37 97 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 CDIPTO14735 213 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 LDB2O43679 373 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 TNFAIP8O95379 198 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 TTC4O95801 387 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 AMY1AP04745 511 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 CD1AP06126 327 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 C8AP07357 584 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 CD72P21854 359 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 BMP8BP34820 402 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 GJC1P36383 396 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 MAP2K4P45985 399 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 GNPDA1P46926 289 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 NFATC3Q12968 1075 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 FOXE3Q13461 319 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 KRT33BQ14525 404 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 KIF19Q2TAC6 998 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 PGGHGQ32M88 737 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 RFX4Q33E94 735 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 IDNKQ5T6J7 187 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 G2E3Q7L622 706 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 LAS2Q8IYD9 372 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 TMEM199Q8N511 208 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 OR7G2Q8NG99 324 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 OR4K15Q8NH41 348 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 KCNA7Q96RP8 456 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ECSITQ9BQ95 431 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 DPH7Q9BTV6 452 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 OR10A5Q9H207 317 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 SNX24Q9Y343 169 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 AQP7P3A6NL99 342 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 DSCR3O14972 297 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 AZIN1O14977 448 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 LAMTOR5O43504 91 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 SYNGR3O43761 229 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 CPNE6O95741 557 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 SPP1P10451 314 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 PMELP40967 661 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ASPAP45381 313 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 CSNK1A1P48729 337 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 PDLIM4P50479 330 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 HLCSP50747 726 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 XKP51811 444 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 DLX5P56178 289 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 RANP62826 216 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 GRIK2Q13002 908 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 FGFBP1Q14512 234 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 RNF151Q2KHN1 245 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 SUSD4Q5VX71 490 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 TMEM234Q8WY98 164 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 MYADMQ96S97 322 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 RAB21Q9UL25 225 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-202ENST00000327307 A0A1B0GVI7 797 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB5O15062 677 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TPST2O60704 377 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 BANF1O75531 89 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 OR2J2O76002 312 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 AP2A2O94973 939 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ACSM4P0C7M7 580 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GZMHP20718 246 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 EDN2P20800 178 aa6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms