RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF6Q9Y252 685 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC1A7O00341 560 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN2O60636 221 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1BO75688 479 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 RCBTB2O95199 551 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 THY1P04216 161 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 PNMTP11086 282 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ICAM2P13598 275 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FMO3P31513 532 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 OMPP47874 163 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 GSSP48637 474 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXL2P58012 376 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKCDQ05655 676 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 GINS1Q14691 196 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 EXT1Q16394 746 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF773Q6PK81 442 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 MISPQ8IVT2 679 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR22Q8IZ63 422 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC9Q92623 222 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 MYDGFQ969H8 173 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2FQ969M7 185 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 NACC2Q96BF6 587 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 LMF1Q96S06 567 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 NODALQ96S42 347 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF114Q9Y508 228 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC119BA6NIH7 251 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SNTNA6NMZ2 147 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 HCRTR2O43614 444 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM20BO75063 409 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ICOSLGO75144 302 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6B1O95007 311 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX14O95416 240 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGN1P05114 100 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 IFI30P13284 250 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 BMP7P18075 431 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TCN2P20062 427 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK5Q00535 292 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TCF15Q12870 199 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SSPNQ14714 243 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 BTBD16Q32M84 506 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 STPG1Q5TH74 334 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS13Q6UX07 377 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 GLRX5Q86SX6 157 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 PIP4P1Q86T03 277 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO6A1Q86UG4 719 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ESX1Q8N693 406 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC15A4Q8N697 577 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 M1APQ8TC57 530 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 GRHL3Q8TE85 626 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf44Q96CB5 159 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP21Q9H596 190 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 IL20Q9NYY1 176 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 CNIH4Q9P003 139 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 MYOTQ9UBF9 498 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 CARD8Q9Y2G2 431 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 NINQ8N4C6 2090 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WUJ7 227 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms