RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 GXYLT1Q4G148 440 aa23.42■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 CDK20Q8IZL9 346 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 KCNN2Q9H2S1 579 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ADGRL4Q9HBW9 690 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 TRAV6A0A075B6T7 132 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 SLC19A2O60779 497 aa23.42■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 NDC1Q9BTX1 674 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 TRPV5Q9NQA5 729 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ADAM30Q9UKF2 790 aa23.42■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ABHD13Q7L211 337 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 OR4C6Q8NH72 309 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 SIPA1Q96FS4 1042 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 CDRT4Q8N9R6 151 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 OR4D9Q8NGE8 314 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 CYSLTR2Q9NS75 346 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 A0A1B0GWA3 101 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 GHSRQ92847 366 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 JAM3Q9BX67 310 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 RIIAD1A6NNX1 92 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 CYR61O00622 381 aa23.39■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-201ENST00000311626 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-201ENST00000311626 OR52E2Q8NGJ4 325 aa23.39■■□□□ 1.33
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HOXB3-201ENST00000311626 ACOXLQ9NUZ1 547 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-201ENST00000311626 EPOPA6NHQ4 379 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-201ENST00000311626 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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