RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 POMZP3Q6PJE2 187 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CADM2Q8N3J6 435 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 FAM162AQ96A26 154 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 GYG2O15488 501 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 LGI1O95970 557 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 FESP07332 822 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ADH6P28332 368 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 LHX2P50458 406 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 MERTKQ12866 999 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 GLYATQ6IB77 296 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 C3P1Q6ZMU1 363 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35B4Q969S0 331 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TPD52L3Q96J77 140 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ACER3Q9NUN7 267 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 M0R3H8 397 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SYT5O00445 386 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 FAAHO00519 579 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SEC14L5O43304 696 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 C8BP07358 591 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PEPDP12955 493 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 IL11P20809 199 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ME2P23368 584 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 NCALDP61601 193 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SPATS1Q496A3 300 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 EMC4Q5J8M3 183 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 DOLPP1Q86YN1 238 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PM20D2Q8IYS1 436 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PROX1Q92786 737 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 WDYHV1Q96HA8 205 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 WFDC6Q9BQY6 131 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 STOML1Q9UBI4 398 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 BAG5Q9UL15 447 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PCNX1Q96RV3 2341 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 NTN1O95631 604 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF682O95780 498 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 OPN1LWP04000 364 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 STSP08842 583 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ELK4P28324 431 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SLC1A3P43003 542 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN18P56856 261 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 GRINAQ7Z429 371 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 LILRA2Q8N149 483 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 RELTQ969Z4 430 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 THTPAQ9BU02 230 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PRDM14Q9GZV8 571 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SH3GLB1Q9Y371 365 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 FLNCQ14315 2725 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 FIGNL2A6NMB9 653 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 H0Y3Z8 333 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PDE5AO76074 875 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINA1P01009 418 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CPN1P15169 458 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF708P17019 499 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CA7P43166 264 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF136P52737 540 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 RAC1P63000 192 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SELENOWP63302 87 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 LZICQ8WZA0 190 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGDIGQ99819 225 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PRR14Q9BWN1 585 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 EFNA2O43921 213 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ATP5HO75947 161 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TNFRSF1BP20333 461 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TACR3P29371 465 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SFTPDP35247 375 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN20P56880 219 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SELENBP1Q13228 472 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 BCL2A1Q16548 175 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 NRF1Q16656 503 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms