RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EfhbQ8CDU5 853 aa11.77□□□□□ -0.52
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osgin2Q3TEE9 550 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r3Q7TQA7 316 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rims3Q80U57 307 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nup107Q8BH74 926 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zcchc3Q8BPK2 400 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stbd1Q8C7E7 338 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Teddm1bQ8CC62 306 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab43Q8CG50 210 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gulp1Q8K2A1 304 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr668Q8VGW3 318 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SmoxQ99K82 555 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 3110001I22RikQ9CZ70 312 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr5bQ9D7H2 328 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam45aQ9D8N2 357 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srpk3Q9Z0G2 565 aa11.77□□□□□ -0.53
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav1A0A075B5Z4 110 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtcflA2APF3 636 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr605E9Q838 314 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r52L7N2B2 852 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa-rs2P17534 91 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P2ry2P35383 373 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PnmtP40935 295 aa11.76□□□□□ -0.53
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MeikinQ5F2C3 434 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nox3Q672J9 568 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sohlh1Q6IUP1 357 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC024139Q8BVJ3 772 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med19Q8C1S0 244 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FlcnQ8QZS3 579 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MrgprhQ99MT8 321 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl8a1Q9DAV8 240 aa11.76□□□□□ -0.53
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrm3Q9ERZ3 589 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem37Q9JJV3 211 aa11.76□□□□□ -0.53
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stxbp1O08599 594 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MyogP12979 224 aa11.76□□□□□ -0.53
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps15aP62245 130 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr629Q0VBH3 314 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MamstrQ0ZCJ7 421 aa11.76□□□□□ -0.53
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lasp1Q61792 263 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt8Q64676 541 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst9Q76EC5 413 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1140Q7TR39 311 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1134Q7TR43 312 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nceh1Q8BLF1 408 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Orai1Q8BWG9 304 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PpcdcQ8BZB2 204 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erlec1Q8VEH8 483 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr54Q8VFE6 313 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frs3Q91WJ0 492 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhj1Q9D240 164 aa11.76□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppil3Q9D6L8 161 aa11.76□□□□□ -0.53
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