RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641815.1

STX3-208, Transcript of syntaxin 3, human

BASIC

Gene STX3, Length 3,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX3-208	ENST00000641815	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GTF2H4	Q92759	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TECTA	O75443	2155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CIT	O14578	2027 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PCM1	Q15154	2024 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		A0A1W2PQ72	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		F8W036	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PIR	O00625	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SCD	O00767	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LILRA1	O75019	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF30	P17039	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TSPAN8	P19075	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CA5A	P35218	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OMP	P47874	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RFX2	P48378	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RGS6	P49758	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GZMM	P51124	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	DAP	P51397	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	WNT3A	P56704	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GRM7	Q14831	915 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LTB4R	Q15722	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	EXT1	Q16394	746 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PCK2	Q16822	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	EPYC	Q99645	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		A0A096LPI6	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ARPC3	O15145	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ADAM12	O43184	909 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SELENOF	O60613	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF623	O75123	536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	APOC1	P02654	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ANXA5	P08758	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CEACAM1	P13688	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CTPS1	P17812	591 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CNR1	P21554	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RIN1	Q13671	783 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		Q6ZSR9	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MED25	Q71SY5	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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