RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 NRF1Q16656 503 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 KANK2Q63ZY3 851 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 ELOA3Q8NG57 546 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 CDS1Q92903 461 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 RADILQ96JH8 1075 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN3-255ENST00000637100 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 RNF212BA8MTL3 300 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CRCPO75575 148 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 FAM153BP0C7A2 387 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CCT5P48643 541 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PDK3Q15120 406 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PPA1Q15181 289 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 FAM153CQ494X1 144 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CFAP157Q5JU67 520 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LIPMQ5VYY2 423 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NATD1Q8N6N6 113 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ZNF527Q8NB42 609 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OR5W2Q8NH69 310 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 COQ8BQ96D53 544 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PRSS50Q9UI38 385 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PLCE1Q9P212 2302 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OR5H1A6NKK0 313 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 H3BNH8 94 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 H6PDO95479 791 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 IGHV1-2P23083 117 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 THBS2P35442 1172 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 DCST2Q5T1A1 773 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TBK1Q9UHD2 729 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 GPRIN2O60269 458 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LYZL6O75951 148 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 KRT16P08779 473 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LINC00032P0C843 101 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 FAM157CP0CG43 387 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LAMP1P11279 417 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ATP6V1C1P21283 382 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 C21orf58P58505 322 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 DSCR9P59020 149 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 VLDLRP98155 873 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 FAPQ12884 760 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ZNF141Q15928 474 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 XKR7Q5GH72 579 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 AGAP6Q5VW22 663 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 IFT20Q8IY31 132 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SFXN5Q8TD22 340 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SDF2Q99470 211 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 A0A1W2PNR3 127 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ZNF716A6NP11 495 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 E7EQL1 145 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ZNF264O43296 627 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 GUSBP08236 651 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NPIPA8P0DM63 369 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 GGT1P19440 569 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms