RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622020.4

NPHP4-211, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPHP4, Length 3,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-211ENST00000622020 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 PPP1R3DO95685 299 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 MT-ND5P03915 603 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CLTBP09497 229 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ERGP11308 486 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RAB3BP20337 219 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 F8A1P23610 371 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 HTR2AP28223 471 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SELENOPP49908 381 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RAB28P51157 221 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 FOXK2Q01167 660 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 COMMD7Q86VX2 200 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 NT5DC2Q9H857 520 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 HK1P19367 917 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 PSMB10P40306 273 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RGS1Q08116 209 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SNTA1Q13424 505 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RIN1Q13671 783 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 DEFB134Q4QY38 66 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 MTSS1LQ765P7 747 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CDH24Q86UP0 819 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 DERL3Q96Q80 235 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 OR10A4Q9H209 315 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 FN3KQ9H479 309 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 MARK1Q9P0L2 795 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 DEC1Q9P2X7 70 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 A0A0G2JK05 382 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SYT5O00445 386 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GPR171O14626 319 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 OR5F1O95221 314 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GRPRP30550 384 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 BTG1P62324 171 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ANGPT1Q15389 498 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 OR2L5Q8NG80 312 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SMPDL3BQ92485 455 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GIMAP5Q96F15 307 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GPR137Q96N19 417 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GPR174Q9BXC1 333 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 B8ZZF3 427 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 IMPA2O14732 288 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 KLF4O43474 513 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GMDSO60547 372 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 LDB3O75112 727 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GALEQ14376 348 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ARHGEF6Q15052 776 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 GXYLT1Q4G148 440 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 HES5Q5TA89 166 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM64Q6YI46 380 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 LINGO2Q7L985 606 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM239Q8WW34 195 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SUSD6Q92537 303 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 OR14A2Q96R54 314 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CLDND1Q9NY35 253 aa14.62□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 J3QRE1 110 aa14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 MID1O15344 667 aa14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 PPM1AP35813 382 aa14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 OR1Q1Q15612 314 aa14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 FTMTQ8N4E7 242 aa14.61□□□□□ -0.07
NPHP4-211ENST00000622020 COX14Q96I36 57 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms